Мы принимаем файлы с данными теста аутосомной ДНК. Поддерживаются результаты тестов от компаний 23andMe, FamilyTreeDNA (FamilyFinder), MyHeritage, AncestryDNA, Генотек и Атлас. Для анализа совпадений будут использованы именно данные из файла с аутосомной ДНК.
Отдельно можно указать (если известно):
- субклад Y-ДНК (для мужчин);
- ветвь мтДНК (для мужчин и женщин).
Эти данные будут отображаться в совпадениях. Кроме того, планируется использовать эту информацию в дальнейшем развитии сервиса (привязка к населенным пунктам на основе данных о местожительстве известных предков по мужской и женской прямым веткам).
При загрузке данных можно выбрать один из вариантов:
- Файл с аутосомной ДНК, субкладом Y-ДНК (для мужчин) и/или ветвью мтДНК — если у вас есть полный набор данных.
- Только аутосомная ДНК — если вас интересует только поиск совпадений.
- Только данные о Y-ДНК и/или мтДНК — если у вас нет аутосомного файла, но есть информация о ваших прямых родословных линиях.
Исходные данные (raw data) — это файл, который содержит информацию о генетических вариантах. Файл может быть в формате .txt, .vcf, .zip, .gz, .gzip или .csv и размером до 30-35 мегабайт. Вы можете скачать файл в соответствующем разделе: у 23andMe в разделе Tools на странице «Browse raw Data»; у Ancestry в разделе Your DNA Results Summary; у FamilyTreeDNA в разделе Results & Tools / Autosomal DNA / Download Raw Data; у MyHeritage в разделе Manage DNA kits; у Генотек в разделе «Исходные данные»; у Атлас в личном кабинете.
Данные о субкладе Y-ДНК (для мужчин) и ветви мтДНК можно получить несколькими способами:
-
Специализированные тесты или полногеномные тесты:
- Y-ДНК — для определения мужской родословной линии. Необходим тест Y-DNA (например, в FamilyTreeDNA) или углубленный анализ секвенирования (например, YFull на основе полногеномных тестов).
- мтДНК — для анализа по материнской линии. Доступен в FamilyTreeDNA (mtDNA) и других лабораториях.
-
Дополнительные данные в аутосомных тестах:
- Некоторые компании, например, Генотек, предоставляют информацию о Y-ДНК и мтДНК в качестве дополнительного результата при тестировании аутосомной ДНК (раздел «Миграции предков»).
- Эти данные могут быть менее детализированы по сравнению со специализированными тестами, но все же позволяют определить основные ветви Y-ДНК и мтДНК.
Если у вас несколько аутосомных тестов, то можно ввести их отдельными наборами, указав соответствующего поставщика. Данные в разных лабораториях могут отличаться.
Если у вас аутосомный тест сделан в одной лаборатории, а Y и/или мтДНК в другой, то в случае, если вы будете указывать данные в одном наборе, приоритетно указать лабораторию, где делался тест по аутосомной ДНК.
Это человек на Familio, результат которого совпал с загруженным вами результатом ДНК-теста. Вы можете перейти на карточку человека и изучить его родословную, нажав на кнопку «Древо». Некоторые пользователи не связали ДНК с человеком. В этом случае отображается просто имя, которое указал пользователь.
Пользователь, загрузивший тест, скрыл данного человека в своем древе. Вы можете связаться с пользователем. В будущем станет доступной информация о предках скрытых людей, которую пользователь решит сделать публичной.
Это человек, загрузивший тест, который обладает правами распоряжаться исходными данными теста и с которым можно связаться и узнать детали по совпадению.
При нажатии на имя пользователя можно перейти в его профиль. Далее нажать на кнопку «Написать пользователю».
Это количество совпадающих фрагментов ДНК между двумя людьми. Чем больше это значение, тем ближе их родственная связь.
ДНК передается через поколения сегментами. Чем больше неразделенных сегментов ДНК у двух людей, тем выше вероятность их родственной связи.
Это единица измерения генетической сцепленности — сантиморган (сМ). В вашей ДНК примерно 7000 сМ: по 3500 сМ от каждого родителя, в которые входят по 1750 сМ от дедушек и бабушек.
В генетической генеалогии родственные отношения выражаются числом: 1.0 — это родные родители/дети/братья-сестры; 1.5 — дяди и тети; 2.0 — двоюродные братья/сестры. Степень родства может выражаться нецелым числом из-за сложных генетических связей и неравномерности передачи ДНК через поколения.
Мы показываем не только вычисленное значение, но и вероятный диапазон родства.
Данный раздел является экспериментальным. Выполняется сопоставление мест рождения предков людей, информация отображается на карте.
Бирюзовый цвет: используется для обозначения мест, совпадающих для обоих людей.
Синий цвет: используется для обозначения мест, относящихся только к добавленному вами человеку.
Красный цвет: используется для обозначения мест, принадлежащих только человеку, совпавшему с вашим.
Фамилии предков обоих людей представлены в виде списков под картой. Совпадающие фамилии выделены бирюзовым цветом, фамилии, относящиеся только к добавленному вами человеку, — синим, а фамилии совпавшего человека — красным.
Карту можно масштабировать, выбрав любой подсвеченный населенный пункт для просмотра его названия и фамилии предка, связанного с данным местом.
Образец ДНК переведен в приватный режим
Причина — аномально большое число совпадений (более половины пользователей базы видят его в своих списках), большинство из которых недостоверны. Мы скрыли эти совпадения, чтобы не вводить в заблуждение ни вас, ни других пользователей.
Почему так произошло?
Файл содержит некорректный набор генетических маркеров. Это может быть связано с технической ошибкой при скачивании или особенностями работы лаборатории.
Что делать?
- На данном этапе писать в техподдержку лаборатории рано — скорее всего, они просто порекомендуют повторно скачать файл. Если тест из Генотек, техподдержка лаборатории может ответить, что загрузка в базу Familio не поддерживается (это не так, но такова их позиция).
- Скачайте файл заново и загрузите его повторно. Если тест из Генотек, попробуйте файлы в разных форматах. В приоритете оригинальные, платные 23andmeV5. Наименее приоритетные — платный 23andmeV3 и бесплатный .vcf. Внимание: файлы 23andmeV5, полученные с помощью ручной конвертации из .vcf, загружать не рекомендуется.
Если проблема не исчезла, загрузите этот же файл в другие открытые базы ДНК (GedMatch, FamilyTreeDNA, LivingDNA и т. д.).
- Если тест из Генотек, то для загрузки в сторонние — отличные от Familio — базы подходят лишь файлы 23andmeV5. Мы рекомендуем использовать именно оригинальный, платный файл. Не стоит самостоятельно конвертировать его из файла .vcf, например, посредством программы DNAKitStudio. В данной ситуации это не сработает.
- Если загрузка в другие базы тоже не удалась — сделайте скриншот ошибки и направьте его в техподдержку лаборатории, а также нам через форму обратной связи.
- Если файл успешно загружается в другие базы, но все еще не загружается в базу Familio — сообщите нам через форму обратной связи. Мы разберемся и постараемся решить проблему.
Такой статус означает, что файл, который вы загрузили, по формату соответствует ДНК-тесту, но самих генетических данных не содержит. Такое изредка случается, например, с файлами из лаборатории FTDNA. При скачивании файла из личного кабинета происходит сбой — в тех позициях, где должны быть значения генетических маркеров, стоят цифры или нечитаемые символы. Чаще всего достаточно просто заново скачать файл ДНК-теста из личного кабинета и заново загрузить его к нам. Но если вы сделали так, и это не помогло (или если вы сомневаетесь, что все делаете верно), — пришлите нам ваш файл на почту dna@familio.org с темой письма «Образец <номер в нашей базе, например, AB12345> не содержит генетических данных». Мы изучим ваш файл и постараемся помочь.
На самом деле можно, но есть нюанс. Сейчас мы не поддерживаем прямую загрузку того файла (.txt GRCh38), который вы можете бесплатно скачать в личном кабинете Атласа. Причина техническая: эта лаборатория использует геномную разметку hg38, а большинство других — hg37.
Если коротко, разметка — это способ пронумеровать строки в файле с данными. Наш алгоритм пока работает только с общепринятой hg37 и не сможет правильно обработать файл с данными, пронумерованными другим способом. Подробно о том, что такое геномная разметка, можно прочесть здесь.
Мы обязательно решим эту задачу, и загрузка тестов Атласа станет такой же простой, как любых других. А пока у вас есть два варианта:
1. Попроще, но с небольшими затратами.
Запросить у Атласа (через личный кабинет или техподдержку) конвертацию ваших данных в формат, подходящий для загрузки, — это платная услуга. В результате вы получите вот такой набор файлов — мы выделили те из них, которые можно загрузить к нам и в другие базы (такие как Gedmatch, FTDNA и т.д.)
- .txt GRCh37
- .vcf GRCh37
- .vcf GRCh38
- формат 23andMe
2. Посложнее, но бесплатно.
Можно самостоятельно конвертировать файл с помощью программы DNAKitStudio и загрузить в Familio. Инструкция приведена ниже.
Инструкция по конвертации файла с помощью DNAKitStudio
- Скачайте архивный файл DnaKitStudiov28.zip по ссылке, сохраните в папке «Загрузки» на своем компьютере
- Распакуйте архивный файл (Правая клавиша мыши > «Извлечь все»), после чего в папке «Загрузки» появится папка «DnaKitStudiov28»
- Зайдите в папку «DnaKitStudiov28» и запустите файл DnaKitStudio
- Зайдите на вкладку RAW Tools > RAW Converter, нажмите кнопку Browse справа в строке Raw Data Input
- Выберите исходный файл ДНК-теста, который вы хотите преобразовать. Нажмите «Открыть»
- Нажмите кнопку Browse справа в строке Raw Data Output
- Придумайте название файла, в котором будет сохранен результат преобразования. Нажмите «Сохранить»
- Слева в строке Use Raw Data Template установите «галочку»
- Справа в той же строке нажмите стрелочку вниз
- В открывшемся меню выберите строку Template_23andme_v5.txt
- Внизу в блоке Options, установите переключатель в положение by RSID
- Справа нажмите Convert
- Справа в окошке «Process finished» нажмите «OK»
- Результат преобразования будет в файле, который вы создали
Пришлите ваш файл на почту dna@familio.org с темой письма «Не могу загрузить образец» или «Образец <номер в нашей базе, например, AB12345> не проходит обработку». В письме опишите ситуацию: в какой лаборатории делали анализ, когда скачали файл из личного кабинета, когда пробовали загружать к нам, что именно пошло не так. Если приложите скриншоты из личного кабинета, нам будет проще разобраться. Мы обязательно ответим и постараемся помочь.